学院设制药工程系、药学系、生物医学系、生物工程系和实验教学中心，服务制药工程、药学、生物医学工程和生物工程4个本科专业，药学学科为重庆市“十二五”重点学科，制药工程专业为重庆市特色专业，药学专业为学校优势专业，生物医学工程为学校潜力学科，生物医学工程专业为学校综合改革试点专业，有生物医学工程一级学科和微生物与生化药学二级学科2个学术学位硕士点，1个生物医学工程领域专业学位硕士点，建有重庆市生物医药实验教学示范中心1个，重庆市药物化学与分子药理重点实验室、重庆市靶向药物筛选及活性评价重点实验室、重庆市现代中药制药工程技术研究中心和中英数字医疗联合重点实验室4个省部级科研平台，建有计算机辅助药物设计与化学生物学团队、代谢性疾病药物药理团队2个省部级科研团队，2个产业化示范基地，2个校企联合实验室，与10多家企业有技术和人才培养合作关系，具备了较完善的科研平台和人才培养条件。

学院现有教授13人，副教授18名，讲师6名，其中兼职院士1名，中组部“千人计划”入选者1人；教育部“新世纪优秀人才”2人；重庆市科技创新领军人才2人，重庆市有突出贡献的中青年专家1人，重庆市巴渝学者1名，重庆市杰青1人，外籍专家3名，重庆市优秀中青年骨干教师2人。主要学科带头人均有海外留学、海外学习或工作经历。

学院秉持“康济天下”办学思想，以培养“卓越产业精英”为育人目标，坚持“创新驱动，产教融合、协同育人、服务健康”的教育理念，重视素质教育，培养国际化视野。学院设有本科层次额度高于国家奖学金的圣华曦优秀学生奖学金，实施全程导师制，学生专业基础扎实，综合素质好，全国竞赛成绩优异，连续7年，学院考取国内知名大学及本校研究生比率位居全校第一名，毕业后的学生成为行业主要技术骨干和管理人才，受到社会各界好评。

学院致力于国家和地方战略性新兴产业生物医药领域知识与技术创新，建有药物创制科研平台，先后承担国家863、国家自然科学基金、国家重大科技攻关、国家新药基金、国际合作、重庆市重大科技攻关和企业合作项目100余项，其中，国家与省部级重大新药创制课题12项。在天然产物药物、靶向药物高内涵筛选、生物技术制药、医疗器械、生物材料等领域形成了特色。近三年科研经费达3000余万元，在国内外核心期刊发表论文300多篇，SCI、EI收录论文80余篇，发明专利20多项，获省部级科技成果奖13项，其中科技进步一等成果奖2项，二等成果奖5项，三等成果奖6项。

学院已同美国、英国、日本、澳大利亚、加拿大等国家有关著名大学、科研机构建立起良好的学术交流关系增强国际联合办学能力。

学院将继续以“育一流人才、创一流成果”为宗旨，着力培养国家和地方生物医药战略型新兴产业急需的高层次创新创业卓越精英人才，提升服务地方经济发展的综合科技创新能力。